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# test/unit/bio/io/test_fastacmd.rb - Unit test for Bio::Blast::Fastacmd.
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# Copyright::  Copyright (C) 2006 Mitsuteru Nakao <[e-mail]>
# License::    The Ruby License
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#  $Id:$
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require 'pathname'
libpath = Pathname.new(File.join(File.dirname(__FILE__), ['..'] * 4, 'lib')).cleanpath.to_s
$:.unshift(libpath) unless $:.include?(libpath)


require 'test/unit'
require 'bio/io/fastacmd'

module Bio

class TestFastacmd < Test::Unit::TestCase

  def setup
    @obj = Bio::Blast::Fastacmd.new('/dev/null')
  end

  def test_database
    assert_equal('/dev/null', @obj.database)
  end

  def test_fastacmd
    assert_equal("fastacmd", @obj.fastacmd)
  end

  def test_methods
    method_list = [ :get_by_id, :fetch, :each_entry, :each ]
    method_list.each do |method|
      assert(@obj.respond_to?(method))
    end
  end

end
end

Version data entries

14 entries across 14 versions & 4 rubygems

Version	Path
bioruby-bio-1.2.9.9001	test/unit/bio/io/test_fastacmd.rb
bioruby-bio-1.2.9.9501	test/unit/bio/io/test_fastacmd.rb
bioruby-bio-1.3.0.5000	test/unit/bio/io/test_fastacmd.rb
bioruby-bio-1.3.0.9901	test/unit/bio/io/test_fastacmd.rb
bioruby-bio-1.3.0	test/unit/bio/io/test_fastacmd.rb
bioruby-bio-1.3.1.5000	test/unit/bio/io/test_fastacmd.rb
ngoto-bio-1.2.9.9001	test/unit/bio/io/test_fastacmd.rb
ngoto-bio-1.2.9.9501	test/unit/bio/io/test_fastacmd.rb
ngoto-bio-1.3.0.5000	test/unit/bio/io/test_fastacmd.rb
ngoto-bio-1.3.0	test/unit/bio/io/test_fastacmd.rb
ngoto-bio-1.3.1.5000	test/unit/bio/io/test_fastacmd.rb
wwood-bioruby-1.2.11	test/unit/bio/io/test_fastacmd.rb
bio-1.3.1	test/unit/bio/io/test_fastacmd.rb
bio-1.3.0	test/unit/bio/io/test_fastacmd.rb