Sha256: 85236ea7fe23d5d0a4ab02d2e78fb724b8b88b0b443c00807b07afd8683edfe0

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Contents

#{{{ FINDER
finder = Finder.new
if ENV['RBBT_FINDER']
  finder.add_instance(KEGG.pathways, :grep => '^hsa\|^#', :fields => ["Pathway Name"], :namespace => "Hsa/jun2011", :fix => Proc.new{|l| l.sub(/ - Homo sapiens.*/,'')})
  finder.add_instance(Organism.lexicon("Hsa/jun2011"), :persist => true, :namespace => "Hsa/jun2011", :grep => '^LRG_', :invert_grep => true)
end
set :finder, finder
Log.debug("Finder started with: #{finder.instances.length} instances")


Version data entries

177 entries across 177 versions & 1 rubygems

Version Path
rbbt-util-5.6.10 etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.6.9 etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.6.8 etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.6.7 etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.6.6 etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.6.5 etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.6.4 etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.6.3 etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.6.2 etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.6.1 etc/app.d/finder.rb
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rbbt-util-5.5.64 etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.5.63 etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.5.62 etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.5.61 etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.5.60 etc/app.d/finder.rb