Contents

#{{{ FINDER
finder = Finder.new
if ENV['RBBT_FINDER']
  finder.add_instance(KEGG.pathways, :grep => '^hsa\|^#', :fields => ["Pathway Name"], :namespace => "Hsa/jun2011", :fix => Proc.new{|l| l.sub(/ - Homo sapiens.*/,'')})
  finder.add_instance(Organism.lexicon("Hsa/jun2011"), :persist => true, :namespace => "Hsa/jun2011", :grep => '^LRG_', :invert_grep => true)
end
set :finder, finder
Log.debug("Finder started with: #{finder.instances.length} instances")

Version data entries

177 entries across 177 versions & 1 rubygems

Version	Path
rbbt-util-5.9.1	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.9.0	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.8.10	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.8.9	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.8.8	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.8.7	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.8.6	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.8.4	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.8.3	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.8.2	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.8.1	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.8.0	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.7.0	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.6.17	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.6.16	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.6.15	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.6.14	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.6.13	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.6.12	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.6.11	etc/app.d/finder.rb