test-cds.gff3 in bio-gff3-0.8.3

- old
+ new

@@ -7,10 +7,12 @@
 MhA1_Contig1040	WormBase	exon	1	182	.	-	.	ID=exon:MhA1_Contig1040.frz3.g
 ene29.1;Parent=transcript:MhA1_Contig1040.frz3.gene29
 MhA1_Contig1040	WormBase	CDS	1	180	.	-	2	ID=cds:MhA1_Contig1040.frz3.gene
 29;Parent=transcript:MhA1_Contig1040.frz3.gene29
 
+
+
 ##gff-version 3 ##sequence-regio
 # Gene gene:MhA1_Contig2992.frz3.gene1
 MhA1_Contig2992	WormBase	gene	577	2176	.	-	.	ID=gene:MhA1_Contig2992.frz3.gene1;Name=MhA1_Contig2992.frz3.gene1;Note=PREDICTED protein_coding;public_name=MhA1_Contig2992.frz3.gene1
 MhA1_Contig2992	WormBase	mRNA	577	2176	.	-	.	ID=transcript:MhA1_Contig2992.frz3.gene1;Parent=gene:MhA1_Contig2992.frz3.gene1;Name=MhA1_Contig2992.frz3.gene1;public_name=MhA1_Contig2992.frz3.gene1
 MhA1_Contig2992	WormBase	exon	2078	2176	.	-	.	ID=exon:MhA1_Contig2992.frz3.gene1.1;Parent=transcript:MhA1_Contig2992.frz3.gene1
@@ -48,10 +50,17 @@
 MhA1_Contig2992	TRF	repeat_region	2688	2730	56	-	.	ID=TRF.57984
 MhA1_Contig2992	RepeatMask	repeat_region	2957	3019	28	+	.	ID=RepeatMask.324638
 MhA1_Contig2992	Dust	repeat_region	2959	3019	.	-	.	ID=Dust.42112
 MhA1_Contig2992	RepeatMask	repeat_region	3194	3237	23	+	.	ID=RepeatMask.324639
 MhA1_Contig2992	Dust	repeat_region	3222	3277	.	-	.	ID=Dust.42114
+##gff-version 3
+##sequence-region MhA1_Contig3426 1 2029
+# Gene gene:MhA1_Contig3426.frz3.gene1
+MhA1_Contig3426	WormBase	gene	192	346	.	+	.	ID=gene:MhA1_Contig3426.frz3.gene1;Name=MhA1_Contig3426.frz3.gene1;Note=PREDICTED protein_coding;public_name=MhA1_Contig3426.frz3.gene1
+MhA1_Contig3426	WormBase	mRNA	192	346	.	+	.	ID=transcript:MhA1_Contig3426.frz3.gene1;Parent=gene:MhA1_Contig3426.frz3.gene1;Name=MhA1_Contig3426.frz3.gene1;public_name=MhA1_Contig3426.frz3.gene1
+MhA1_Contig3426	WormBase	exon	192	346	.	+	.	ID=exon:MhA1_Contig3426.frz3.gene1.1;Parent=transcript:MhA1_Contig3426.frz3.gene1
+MhA1_Contig3426	WormBase	CDS	192	346	.	+	0	ID=cds:MhA1_Contig3426.frz3.gene1;Parent=transcript:MhA1_Contig3426.frz3.gene1
 ##FASTA
 >MhA1_Contig2992
 TTTTGGTGACCAAAGTTCCTATTGGTGACCAAAATTCCAGTGCCCAATATTCCGTTTTTTGACTTGGTGACCAAAATTCC
 GCTGGTGACCAAAATTCCAAAAAATTGGTGACCAAAGTTCCGAAAAATCTTGGTGACCAAAATTCCGGTGACCAAAATTC
 TGGGACTCCTCAGGTTCGATGCCTGGCGGCAGCTGGTGGCCGGTTTAGTGTAGTCCCTGTATAGCACTTACACAGGTGGC
@@ -94,5 +103,11 @@
 TAATATTCTCCATTTCTTTCCAATCAAAATTATTCTTTATTTCAAAACTATTCCAAAAATTATCCAAAATTCCAATTAAA
 TATTTTTTGTTAAATAAAAGGTTTAAATTAATTATTTGTGCTTTTTCGAATTTTTCATTTAAATCCTTTATTTTTTTGAA
 ATTATCATAAAGCTCTAATGATGCTTTTTGAATTTTTGAGACATTTTCAATATCAAAATTTGGTCCGGAAAATTTATTTA
 >MhA1_Contig1040
 TTAATTAATTTGCCTAGAAAAACAAAGGCATAACATGCTTGCAGTCATCATACGGTAAGAGAGAAACCAACGATATGTTAATAATGTTGATGGGGGAATATCCTCATTAGAATTCTTTTTTGGGTGAATTGAAATTGCCATATTATTAGTATTATTAGAAAATATTAAATTTGTTGATAAAC
+>MhA1_Contig3426
+TTAATAAATTTAATTCATTAAAATTTTAAAAAGAAAGGGACATTCGAGGGGAAATGAGAGAGAACGAGAGAAAATGGACG
+GGAAATTAAATTAAAAAATAAAAAATTAATTTTTATTTTTTTTTATTTAATTTAAAATTAATTTTCTACATTTATTAAAT
+CTTAAATTATTAATTTTAAATTAATTTAAAG GCATCCAACAACAACAATTAGAAGTCTTTCCCAGCTCCTCCTCTGCCCC
+TCAGCAACAACAATACCCAGCGCAGCAGCTTCAATTAGTTACTCCTTTTATTGCATGCATAGCAGATGAATTGAGGGAGT
+TGATAGATGAAATGCGTATGTTTTAG AATATTTTTTAAAAAAAAATTAAAAAAAATTTTTTTTTGCCAAACAGGCTCTCG