seq1 = sample10-1.fst, 96 bp seq2 = sample10-2.fst (genome1), 599 bp >mrna1 >genome1 1-42 (143-184) 100% <- 43-96 (404-457) 94% 0 . : . : . : . : . : 1 AGTTGTTTCCGTCGCTGGTTATTGTCTAGAACGCAAAAATAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||<<<...<< 143 AGTTGTTTCCGTCGCTGGTTATTGTCTAGAACGCAAAAATAGCTG...TA 50 . : . : . : . : . : 43 TCTACACATCACTAGCGTGGGTGGGCGGAAAGAGCAGCTCGCCACT CA <|||||||||||||||| |||||||||||||-|||||||||||||||-|| 403 CTCTACACATCACTAGCCTGGGTGGGCGGAA GAGCAGCTCGCCACTTCA 100 . 91 AGCTAA |||||| 452 AGCTAA