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#{{{ FINDER
finder = Finder.new
if ENV['RBBT_FINDER']
  finder.add_instance(KEGG.pathways, :grep => '^hsa\|^#', :fields => ["Pathway Name"], :namespace => Organism.default_code("Hsa"), :fix => Proc.new{|l| l.sub(/ - Homo sapiens.*/,'')})
  finder.add_instance(Organism.lexicon(Organism.default_code("Hsa")), :persist => true, :namespace => Organism.default_code("Hsa"), :grep => '^LRG_', :invert_grep => true)
end
set :finder, finder
Log.debug("Finder started with: #{finder.instances.length} instances")

Version data entries

20 entries across 20 versions & 1 rubygems

Version	Path
rbbt-util-5.14.39	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.14.38	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.14.37	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.14.36	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.14.35	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.14.34	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.14.33	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.14.32	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.14.31	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.14.30	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.14.29	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.14.28	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.14.26	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.14.25	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.14.24	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.14.23	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.14.22	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.14.21	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.14.20	etc/app.d/finder.rb
rbbt-util-5.14.18	etc/app.d/finder.rb