#! /usr/bin/env ruby # coding: utf-8 require "fileutils" require "pp" require "date" require "yaml" require "rubygems" gem "comana" require "comana/computationmanager.rb" require "comana/machineinfo.rb" require "vasputils/incar.rb" require "vasputils/outcar.rb" require "vasputils/poscar.rb" require "vasputils/kpoints.rb" # Class for VASP executable directory, # including input and output files. # class VaspDir < ComputationManager class InitializeError < Exception; end class NoVaspBinaryError < Exception; end class PrepareNextError < Exception; end class ExecuteError < Exception; end def initialize(dir) super(dir) @lockdir = "lock_vaspdir" %w(INCAR KPOINTS POSCAR POTCAR).each do |file| infile = "#{@dir}/#{file}" raise InitializeError, infile unless FileTest.exist? infile end end # 配下の OUTCAR を Outcar インスタンスにして返す。 # 存在しなければ例外 Errno::ENOENT を返す。 def outcar Outcar.load_file("#{@dir}/OUTCAR") end # 配下の POSCAR を Cell2 インスタンスにして返す。 # 存在しなければ例外 Errno::ENOENT を返す。 def poscar Poscar.load_file("#{@dir}/POSCAR") end # 配下の CONTCAR を Cell2 インスタンスにして返す。 # 存在しなければ例外 Errno::ENOENT を返す。 def contcar Poscar.load_file("#{@dir}/CONTCAR") end # 配下の KPOINTS を読み込んだ結果をハッシュにして返す。 # # 存在しなければ例外 Errno::ENOENT を返す筈だが、 # vasp dir の判定を incar でやっているので置こる筈がない。 def incar Incar.load_file("#{@dir}/INCAR") end # 配下の KPOINTS を読み込んだ結果をハッシュにして返す。 def kpoints Kpoints.load_file("#{@dir}/KPOINTS") end # 正常に終了していれば true を返す。 # 実行する前や実行中、OUTCAR が完遂していなければ false。 # # MEMO # PI12345 ファイルは実行中のみ存在し、終了後 vasp (mpi?) に自動的に削除される。 def finished? begin return Outcar.load_file("#{@dir}/OUTCAR")[:normal_ended] rescue Errno::ENOENT return false end end private # vasp を投げる。 def calculate begin info = MachineInfo.load_file("#{ENV["HOME"]}/.machineinfo").get_info(ENV["HOST"]) vasp = info["vasp"] rescue #vasp = "vasp" raise NoVaspBinaryError, "No vasp path in #{ENV["HOME"]}/.machineinfo" end command = "cd #{@dir};" command += vasp command += "> stdout" end_status = system command raise ExecuteError, "end_status is #{end_status.inspect}" unless end_status end def prepare_next #do_nothing raise PrepareNextError, "VaspDir doesn't need next." end end